Les dangers biologiques d'origine alimentaire concernent des micro-organismes tels que des virus, certaines bactéries, des moisissures et des parasites.
Ces micro-organismes sont fréquemment associés aux individus et aux produits crus qui entrent dans la chaîne de fabrication alimentaire.
Plus de ces organismes font partie de la flore naturelle de l'environnement dans lequel les produits alimentaires sont cultivés.
La plupart sont détruits ou rendus inactifs à la cuisson des aliments et leur quantité peut être maintenue à un niveau bas en maîtrisant les règles d'hygiène, de température, de durée de conservation... Tout ce qui concerne les conditions de manipulation et de stockage du produit.
La plupart des TIAC (Toxi Infections Alimentaires collectives) sont causées par des bactéries pathogènes.
Ces bactéries peuvent être contenues naturellement dans certains aliments crus.
La prolifération des bactéries dans les aliments est souvent causée par des mauvaises conditions de manutention et de stockage.
En effet, s'ils sont mal manipulés ou stockés, les aliments peuvent constituer un milieu de culture fertile pouvant faire croitre des germes indésirables.
Les virus sont différents des bactéries, ils ne sont pas capables de se reproduire en dehors d'une cellule vivante.
Ils ne peuvent donc pas se multiplier dans les aliments, mais seulement être véhiculés par ces derniers.
Les virus peuvent être d'origine alimentaire, ils peuvent provenir de l'eau ou être transmis aux aliments par des humains, par des animaux ou par d'autres contacts.
On pense que les parasites ont souvent comme hôte les animaux, mais ils peuvent également inclure les humains comme hôte spécifique dans leur cycle de vie.
Les infections parasitaires peuvent se témoigner lors de la consommation de produits carnés crus ou insuffisamment cuits ou d'aliments prêts à être consommés.
Grâce à une congélation efficace, les aliments destinés à être consommés crus, marinés ou partiellement cuits, peuvent être débarrassés de leurs parasites.
Les moisissures et les levures ne sont pas forcément néfastes : elles sont bénéfiques dans la production de certains aliments tels que le fromage.
Cependant, certains champignons produisent des substances toxiques, connues sous le nom de mycotoxines. Ces dernières sont aussi bien dangereuses pour les être humains que pour les animaux.